使命召唤13无限战争游戏主线为人类征服太阳系，地球军与地外星球殖民军因冲突展开战争的设定，游戏主角为地球联盟军的特种作战部队长Reyes，操控地球军战舰同殖民军对抗，这架战舰同《黑色行动3》相同，将作为用户的基地，包括作战部署，武器搭配内容，当然主角还可以驾驶一架专属战机。

　　由于地球人口增长和工业扩张，导致地球上自然资源枯竭，而《使命召唤13》的故事便发生在这之后。地球上的居民依靠建立在太阳系其他星球和小行星上的殖民地资源生存。然而外星球上建立的殖民地的价值被好战分子发现(也就是下文中的反派敌人The Front)，这些人希望能控制这些殖民地，导致地球上各国之间关系比较紧张。后来一个联合国太空联盟被建立，但是这个组织所扮演的角色和成立的目的目前尚未公布。

　　在无限战争之前，在分裂战争时一群暴乱分子退出联合国太空联盟，成立了反派组织The Settlement Defense Front。The Front被称之为是一个“法西斯力量”。由于多年以来联合国太空联盟未能剿灭The Front组织，陷入了可怕的僵局，导致整个太阳系处在战争的边缘。